无症状/亚临床甲状腺功能减退
无症状/亚临床甲状腺功能减退症，即促甲状腺素（TSH）升高，游离T4正常，则监测促甲状腺素（TSH）、游离T4，每4-6周1次（对于基线甲状腺功能无异常或无症状的患者，如有指征，可将甲状腺功能检测间隔延长到每12-18周），如果TSH升高，则根据TSH水平进行治疗或在4-6周内复查TSH、游离T4。
若TSH升高在4~<10之间，无症状，游离T4正常，则继续免疫治疗，继续监测甲状腺功能（TFT）；若TSH升高(>10)，游离T4正常，则继续免疫治疗，考虑左旋甲状腺素（目标是使TSH达到参考范围或适合某个年龄段的范围）。
若TSH正常或低，游离T4低，则考虑暂停免疫治疗直到不再有症状，或按垂体炎治疗。
促甲状腺激素（TSH）是腺垂体分泌的重要激素，其生理功能是刺激甲状腺细胞的发育、合成与分泌甲状腺激素。TSH的测定最常用于甲状腺功能的评估，也可用于腺垂体功能的测定和下丘脑疾病的诊断。
血清游离T4是由甲状腺滤泡细胞合成后，分泌的一种甲状腺激素。血清游离T4具有高度生物活性，能准确地反映出甲状腺功能的高低。除此之外血清游离T4在促进人体生长发育、新陈代谢上具有重要作用，测定血清游离T4能够观察甲状腺功能的变化，若血清游离T4增高则提示患有甲亢以及相关疾病，降低则提示甲减或者低蛋白血症等。
有临床症状的原发性甲状腺功能减退
有临床症状的原发性甲状腺功能减退症，即TSH升高（>10）、游离T4低，通常有临床症状，监测TSH、游离T4，每4-6周1次（对于基线甲状腺功能无异常或无症状的患者，如有指征，可将甲状腺功能检测间隔延长到每12-18周），继续免疫治疗，考虑请内分泌科会诊，补充甲状腺激素，排除伴随肾上腺皮质功能不全。
甲状腺毒症
甲状腺毒症，即确定为TSH抑制，可以是：a）如果游离T4正常，则为亚临床性；b）如果游离T4高，则为临床性。TSH抑制大多是由于一过性或进行性无痛性甲状腺炎所致。TSH低或抑制伴游离T4/总T3高，考虑检测甲状腺过氧化物酶（TPO）抗体和促甲状腺激素受体抗体（TRAb），如果有症状，考虑请内分泌科会诊。如果无症状，继续免疫治疗；根据症状需要考虑普萘洛尔（根据需要每4-6小时10-20mg）或阿替洛尔或美托洛尔治疗，直至甲状腺毒症消失；在4-6周内复查甲状腺功能；如果解决，则不进一步治疗，如果仍然有TSH抑制、游离T4/总T3高，则4~24小时内进行碘123甲状腺摄取/扫描以确定是否为甲状腺功能亢进和Graves病；甲状腺功能亢进常发展为甲状腺功能减退，若TSH升高>10，则开始左旋甲状腺素治疗。
中枢性甲状腺功能减退
中枢性甲状腺功能减退症即TSH低或抑制伴有不适当的游离T4低。评估皮质醇（AM）、 FSH、LH、TSH、游离T4、DHEA-S；女性检测雌二醇；男性检测睾酮；如果证实中枢性甲状腺/肾上腺功能不全，则考虑垂体MRI，考虑暂停免疫治疗直到不再有症状；按垂体炎治疗。